增值税留底退税账务处理主要由以下几步组成： （1）国税机关对增值税留底的核实：核实的内容包括企业本期可抵扣进项税额是否符合实际情况；原材料消耗是否充分；未使用的原材料是否真实存在；企业在调整账户的情况下，是否会产生漏税等情况。 （2）增值税留底退税的申报：经过核实后，企业必须按照国家税务机关要求报送增值税留底退税申报表，供税务机关审核。 （3）增值税留底退税的确定：根据税务机关要求，准确预缴税金，申报正确，税务机关经审核后给予审批，确定企业可以退还的税款金额。 （4）增值税留底退税的收取：经国家税务机关审核批准后，企业将向税务机关收取增值税留底退税。 拓展：申报后，企业应定期报告税务机关收入情况，如果检查发现有出现漏缴的行为，需要做补税处理；如果检查后发现企业收入高于申报，需要补缴相应的增值税。