增值税留底退税是指企业在进行增值税申报时，将应纳增值税留底，用于后续期间的抵扣或退税。其会计处理如下：
1. 在增值税纳税申报表中，填写“应纳税额”和“留底税额”两栏。其中，“应纳税额”为实际应纳的增值税金额，“留底税额”为企业自行决定留下的一部分税额。
2. 在会计账簿中，将“留底税额”记入增值税留抵退税科目中。该科目为资产类科目，应列入资产负债表中。
3. 在后续期间，如企业需要抵扣或退税时，可将留底税额用于抵扣或退税。具体操作可在增值税纳税申报表中填写“抵扣税额”或“退税金额”栏。

需要注意的是，企业留底税额的比例应符合税法规定，且留底税额不能超过企业实际应纳税额的50%。同时，企业在使用留底税额时，应按照税法规定进行抵扣或退税，避免出现违规行为。