在审计企业账上应交税金有余额时，需要从营业税和企业所得税明细入手，详细查看应交税金的收支情况，认真分析发票和票据，以及账簿记录准确性，以验证该企业应纳税额是否合规或实际产生了税收。另外，还要检查企业是否减免税收、是否有逃漏税收等。拓展知识：审计时，还需要查验全面交税的情况，检查企业一年内应纳税种、税率是否正确，实务上的税收申报是否准确，同时还要检查考虑企业减免税、税收优惠等情况。