作废电子普票的处理流程如下： 1、用户将开错的电子普票凭证打印出来，并在凭证上用笔盖上“作废”的字样； 2、用户登录普通发票审核平台，选择“电子普票”，依次填写发票代码、发票号码、开票日期，然后点击“查询”按钮查询开错的电子普票信息； 3、在查询出的信息中，点击“作废”按钮，输入作废原因，并勾选“我已将凭证打印出来，并在上面用笔盖上“作废”的字样”，点击“确定”按钮，即可完成电子普票的作废处理记录。 拓展知识：税收稽查机关也能使用最新的电子普票工具完成稽查活动，实现快速便捷的查验任务，保证税收征管的质量和效率。