增值税填写营业款应该填在应税服务项目收入科目（如商品销售收入）下，具体科目编号可以根据具体情况确定，填写后应当按正常程序办理税务登记手续。 具体的税务处理流程如下： 1）首先，需要及时登记开具专用增值税发票，属于税收征管范围内的营业款收入，应当根据《增值税专用发票管理办法》即每次交易或者一次性交易不超过5000元的，当现场开具专用增值税普通发票，交易超过5000元的，可以根据《 增值税发票管理办法》即线上开具，线下抄张。 2） 将营业款数据入账，及时进行税务登记，当税务登记的营业款实际进入账到财务账户后，应当及时办理税务登记，在财务账户入账的税务登记中，应当确保登记项目、金额与营业款实际入账情况相符合。 3） 完成税务登记后，应当在税务系统内开具专用增值税发票，如果专用增值税发票忘记开具或者开具不完整，则可以根据《营业税发票补打管理办法》，补打缺失的专用增值税发票。 此外，在税收征管内，建议企业特别关注税务管理工作，及时完成应税服务收入的登记、发票开具、税收核定等流程，有效缩短税收征管期，降低税收管理成本。有效掌握税收管理中的法律法规，全面了解税收征管业务，以便实施正确的税务管理工作，避免出现处罚的风险。