进出口公司进仓费应计入应付运费科目，具体归入哪一科依据企业具体财务制度决定，一般会归入如下科目： ①应付运费：进出口货物运输类费用，包括海运费、空运费、陆运费以及进仓费及其他运输有关的其他费用，应归入应付运费科目； ②存货类：如果是外贸进口货物入仓，需归入存货类科目，入库费用及进仓费也应归入存货类； ③其他应付款：如果企业有付款到其他机构，这部分进仓费应归入应付款科目； ④其他支出：如果是企业自行外办，运输、入仓等一类费用应归入其他支出科目； 总之，进出口公司进仓费应根据企业具体情况合理进行归属，择优归入到上述四类科目中，以便更好地掌握支出情况，更好地控制财务成本。 拓展知识：进仓费，指发生在运输过程中的费用，它可能包括登记费、仓储租金以及装卸费等。此外，进仓费还可以指实际发生的运费，如果买方支付进仓费，则可以在应付账款科目上扣除。