老师您好，申请独立核算和仍存税收往来之间并无必然联系。根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，独立核算是企业根据自身管理需要，依据预算、决算和财务报表的原则对企业的资产、负债、收入、支出等进行单独核算的机制，它完全是企业内部行为，而税务往来则是企业间的行为。当公司存在子公司时，两者之间就会产生税务往来，如子公司拨款给总公司、总公司转让资产给子公司等，此时，总公司和子公司之间会有税务往来，影响子公司的所得税。而相对独立核算，只要企业内部有单独的识别手段，就可以根据财务数据进行独立核算，不会受到税务往来的影响。 拓展知识：独立核算的实施可以使企业的内部控制有效，尤其是大型企业。只有独立核算才能更好地控制资金流动，避免资金滥用、虚报开支等问题，更好地进行财务报表汇总和盈利分配。同时，它也可以帮助企业了解自身发展情况，合理安排未来发展战略，帮助管理层更好地进行管理和决策。