是的。转账或其他付款超过1000万元的，都可能被税务机关严格稽查，以检查该款项是否合法，是否有税收规避的情况发生。对于分公司刚刚成立的情况，总公司转往来款达到上千万，尤其需要引起注意。 企业应该及时准备相关财务及税务文件，证明款项的来源，避免被税务机关稽查甚至立案查处。此外，应明确用途，按规定做好发票章程，及时核实税务申报，保证财务的合法性和准确性，并以此为依据进行费用核算，以确保税收的合法性和安全性。 此外，总公司给分公司转账也需要注意资金使用，防止出现流失财产的情况，同时也要保证资金安全，避免被非法侵吞或被骗影响企业发展，投资者的利益受损。