是的，在开具发票时，对方公司没有填写我方的纳税人识别号，是一种违规行为。要想解决这一问题，就应该通知对方公司进行红冲。红冲就是在原发票上作废，经过红冲处理后，发票作废，发票的原始数据不再有效，变成新的发票。红冲也可以指更改原发票的单价、数量等信息，但金额不变。 对于对方公司开出的电子发票，如果没有我方的纳税人识别号，影响到发票的有效性，就应该通知对方公司进行红冲。据《2015年财政部和税务总局关于销售收入核算及发票管理的通知》的规定，税收当事人购买商品或接受服务，发票发生单位应在发票上填写购买方的纳税人识别号。对于没有填写纳税人识别号的发票，不能参与相关的税收往来，是存在违反规定的行为。 此外，在进行发票红冲时，应当注意以下问题：首先要准备发票报送打印程序，验证发票信息和内容；其次要核对应税款数、原发票号和内容，确保红冲后的发票明确，以保证报税正确；最后，需要保持原发票，以便以后查询与验证。