首先，我们应该确认是否是运输公司在购买那辆二手车的发票开的太低，还是卖家单独开的发票太低了。如果是卖家单独开的发票太低了，可以向卖家索要更高的发票，以便更正税款。如果是运输公司自己开的发票太低，则应仔细审查购车发票，以决定是否可以将发票改正至税款要求的标准。 此外，可以考虑请专业的会计师代表运输公司向税务局提出书面申请，要求降低罚款。如果申请被接受，罚款也可以减少。申请时，需要准备合法的证据支持，如购车发票、相关凭证等，以便对税务局进行有效证明。 拓展知识：要想减少车辆买卖引发的税收风险，可以通过以下方法来缓解：首先，要定期核实购车发票，确保税务局的税费标准；其次，在买卖车辆时，可以在双方之间签署相应的协议，以保护双方的权益；第三，车辆的买卖应按税收规定实施，以减少误差和风险；最后，可以与专业的会计师合作，以提高咨询专业度，合理化买卖的过程。