差额征税的企业按发票金额记账时，应结合业务操作流程，从入库单、销货单等分析出发票的金额，登记发票登记明细。按照发票的金额在企业会计凭证上记账，一般为借方：营业收入，贷方：应交税费，税费款，应交增值税及其他税费。企业应及时计算应纳税额等，以确保准确无误。拓展知识：差额征税指的是，企业根据不同项目、不同产品交纳的政府收取的税金是不同的，政府根据企业从事的业务种类和生产的产品来确定所缴纳的税款金额。