代发农民工工资时需要交税，根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，对雇主帮助农民工实现劳动报酬，且工资支付给国家认可的社会保险机构给予农民工所需支付的应纳税所得额，必须扣除应纳税所得额税款。拓展知识：为了充分保护农民工权益，我国还出台了《中华人民入共和国劳动合同法》，要求雇主应该与农民工形成双方合意的劳动合同，明确双方的权利义务，使得农民工获得足够的合法保护和公正的待遇。