根据相关税收法规，建筑总包应该给农民工代发工资，如果农民工工资超过5000，则应该交缴个人所得税，而由哪个单位交税，则取决于承包单位与建筑总包之间的合同规定。如果总包已经将合同金额付给承包单位，由承包单位把个税付给政府，如果承包单位已发票，则承包单位应以发票金额计算个税，把个税付给政府。 另外，建筑企业不仅要确保个税按时交纳，还要注意所支付的工资要与员工签订的劳动合同相符，以及对劳动者拖欠工资等行为进行严格把关，同时要贯彻落实大中小型建筑工程企业实行劳动用工统一定价制度，经济社会稳定发展。 拓展知识： 我国税收分为国家税收和地方税收，建筑企业除了要缴纳个税外，还要缴纳企业所得税、增值税、营业税等，其中，企业所得税是一种定点收取、按年收取的税收，是建筑业中最重要的税收。