代扣员工个人所得税应计入应交税费-个人所得税科目。个人所得税分为全额征收和减除计征两种方式，减除计征的代扣税款计入企业的支出，应分别录入财务账簿。当企业代扣代缴的个人所得税额，计入贷方应交税费-个人所得税，借方银行存款。这样就可以对照报表核对个人所得税支出，以及计提减免税金额和汇缴额度是否准确。 拓展知识:在计算企业计提个人所得税的时候，应当根据企业的收入情况和纳税人的特殊情况（如家庭收入情况，子女抚养费等），确定具体的减除计征方式、比例和金额，以便更好的计提缴纳企业的税款。