你好，土地增值税清算，印花税是可以扣除的。不仅印花税可以扣除城建税、教育费附加都可以扣除。在允许扣除的项目里，税金是单独的一项，开发费用中不包括税金。 《财政部 国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》(财税字[1995]48号)规定:九、关于计算增值额时扣除已缴纳印花税的问题细则中规定，允许扣除的印花税，是指在转让房地产时缴纳的印花税。房地产开发企业按照《施工、房地产开发企业财务制度》的有关规定,其缴纳的印花税列入管理费用，已相应予以扣除。其他的土地增值税纳税义务人在计算土地增值税时允许扣除在转让时缴纳的印花税. 针对什么企业: 1、针对房地产企业,其中的印花税计入管理费用,在算土地增值额时不能扣除,但在算企业利润时可以扣除. 2、针对非房地产企业,其中的印花税在转让房产时就在土地增值额中扣除了,所以在算企业利润时就不能扣除了. 所以说,地产企业在以前会计年度中算利润时如果没有扣除印花税,在清算时肯定要扣的;如果在以前年度利润计算时已经扣除了,有相关的凭证证明就不用扣除了.可能你说的情况属于前者。