丢失了增值税专用发票后，首先应分清丢失发票的责任，如是销售方的责任，应接受税务机关作出的未按规定保管发票的处罚；而如是购买方的责任，需要求对方出具丢失发票的说明或主管税务机关对其未按规定保管发票行为的处罚证明，然后分下列情况处理： 1、销售方丢失增值税专用发票 　　（1）丢失空白未开具的增值税专用发票的，首先按规定程序向销售方当地主管税务机关、公安机关报失，接受税务机关处罚；其次，由主管税务机关代收取“挂失登报费”，并将丢失专用发票的纳税人名称、发票份数、字轨号码、盖章与否等情况，统一传（寄）中国税务报社等税务报刊杂志上刊登“遗失声明”。 　　（2）销售方丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联的，待申报、报税后向主管税务机关申请出具《丢失增值税专用发票已报税证明单》，并把该证明和丢失发票的记账联复印件交购买方抵扣。 　　（3）销售方丢失已开具专用发票的抵扣联、发票联其中一联（两联没有全部丢失）的：可让购买方使用未丢的联次到主管税务机关认证和记账，复印件留存备查。