老师，请问我们是医药连锁公司，有25家门店，总公司是一般纳税人，20家门店是总部统一核算，增值税企业所得税都是总部统一申报，5家是独立核算，增值税跟企业所得税门店自己申报，公司有网上销售，开的抬头是独立核算的门店，但是上游公司给我们开票都是开到总公司了，独立核算的门店没有成本发票，我这个独立核算的门店纳税申报应该怎么申报，账务怎么处理？