您好， 独立核算是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。独立核算单位的特点是：在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户；独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同，独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。    非独立核算又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。非独立核算单位的特点是：一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。    根据《中华人民共和国税收征收管理法》第15条、19条的规定，企业和企业在外地设立的分支机构属于从事生产经营的纳税人，按照法律、行政法规和国务院财政、税务主管部门的规定设置账簿。如果你分公司属于独立核算的纳税人，应当独立建账核算；如果你分公司不属于独立核算的纳税人，财务并入总公司统一核算管理，是否要建立有关辅助帐、明细帐，可由总公司确定。  各有利弊，你可以根据实际情况来选择 对于税款的问题，企业所得税上没有变化，因为分公司是要汇总到总公司合并纳税的。至于增值税，可能会出现总公司是一般纳税人，分公司可能是一般纳税人，也可能小规模纳税人。