一、地下车库的成本可以根据会计核算的不同情况在土增税中扣除。地下车库如果属于人防设施，那么不能对其进行单独核算，其发生的直接费用按照公共配套设施费进行处理。该种地下车库可以在相关项目进行土地增值税清算时进行扣除。 二、如果地下车库不是人防设施，可以办理产权的，那么可以作为单独成本单位进行成本归集，该种车库在单独被出售后进行土增税清算时可以扣除