根据《增值税暂行条例》规定，总机构和分支机构不在同一县（市）的，应当分别向各自所在地主管税务机关申报纳税。经财政部和国家税务总局或者其授权的财政和税务机关批准，也可以由总机构汇总向总机构所在地主管税务机关申报纳税。 北京总公司的成都分公司是非独立核算，一般情况下，增值税由成都分公司向其所在地主管税务机关申报纳税。但如果符合相关条件并经批准，也可以由北京总公司汇总向总公司所在地主管税务机关申报纳税