公司车辆卖掉款项的入账方式取决于公司的会计政策和所适用的会计准则。一般情况下，可以按照以下步骤进行入账：
1. 记录固定资产的减值损失：如果公司车辆的净值低于其账面价值，需要先计提固定资产减值损失。这样可以确保公司以公允的价格出售车辆。
2. 记录固定资产的出售：将车辆从固定资产清单中删除，并记录出售日期和出售价格。出售价格应该是车辆的公允价值，可以通过评估、市场价格或交易价格来确定。
3. 记录固定资产的累计折旧：根据车辆的使用年限和折旧方法，计算并记录该车辆的累计折旧金额。
4. 记录固定资产的原值：将车辆的原值（购买价格）与累计折旧金额相减，得到车辆的净值。将净值从固定资产账户中删除。
5. 记录出售款项：将出售车辆的款项记录为现金或应收账款。如果是现金交易，则直接将款项记录为现金账户。如果是应收账款，需要在应收账款账户中记录。
6. 记录差异：将出售款项与车辆的净值进行对比，如果有差异，则将差异记录为损益。如果出售款项高于净值，则差异为利润；如果出售款项低于净值，则差异为亏损。

需要注意的是，以上步骤仅为一般情况下的处理方法，具体操作还需根据公司的会计政策和所适用的会计准则进行调整。建议在进行这类交易时，咨询专业会计师或依据公司的内部会计政策进行相应的处理。