小规模纳税人的纳税申报方式有两种：一般纳税人和简易计税方法。
1. 一般纳税人：小规模纳税人可以选择一般纳税人纳税方式，按照增值税一般纳税人的规定进行纳税申报。一般纳税人需要按月进行纳税申报，填报增值税纳税申报表，并在规定的时间内缴纳税款。
2. 简易计税方法：小规模纳税人也可以选择简易计税方法，按照固定比例征收增值税。简易计税方法适用于年销售额不超过500万元的小规模纳税人。按照简易计税方法纳税的小规模纳税人，可以按季度进行纳税申报，填报简易计税方法纳税申报表，并在规定的时间内缴纳税款。

需要注意的是，选择纳税方式后，小规模纳税人在一年内不能随意更改，一般需要在年初确定纳税方式，并在纳税申报时持续执行。