当企业与供应商或承包商签订合同时，通常需要支付一定金额的履约保证金作为保证履行合同的义务。当合同履行完毕后，履约保证金可以退还给企业。在会计上，扣除履约保证金的会计分录如下：
1. 当支付履约保证金时：
借：履约保证金支出账户
贷：银行存款账户
2. 当合同履行完毕，退还履约保证金时：
借：银行存款账户
贷：履约保证金支出账户

这样，借方和贷方金额相等，保持会计平衡。履约保证金支出账户记录了支付履约保证金的金额，银行存款账户记录了退还履约保证金的金额。