在计算均数差异标准误时，除以样本量的平方根是因为样本量的大小会影响到均数差异的可靠性。

标准误是对样本均数的抽样误差进行估计的一种度量。抽样误差指的是从一个总体中随机抽取样本所导致的估计值与总体参数之间的差异。

当样本量较大时，抽样误差通常会减小，因为更多的样本可以更好地代表总体。而当样本量较小时，抽样误差通常会增大，因为较小的样本容易受到随机因素的影响。

通过除以样本量的平方根，可以将抽样误差与样本量进行标准化比较。这样，不同样本量的均数差异标准误可以进行比较，从而更好地评估均数差异的显著性。

因此，在计算均数差异标准误时，除以样本量的平方根是为了考虑样本量对均数差异的影响，并使得比较具有不同样本量的均数差异更加准确和可靠。