小规模纳税人免增值税的入账凭证填制如下：
1. 借：应交税费（或应交增值税）-免税销售
   贷：销售收入
2. 借：应交税费（或应交增值税）-免税销售
   贷：应交税费（或应交增值税）—进项税额

说明：
- 在借方的科目中，应交税费（或应交增值税）-免税销售表示将免税销售部分的应交税费（或应交增值税）记入该科目。
- 在贷方的科目中，销售收入表示免税销售的金额。
- 如果存在进项税额，需要在借方增加一条科目，表示将进项税额记入应交税费（或应交增值税）。

需要注意的是，具体的会计科目和科目代码可能会根据不同的企业和会计制度有所差异，建议根据实际情况进行调整。此外，如果企业还涉及其他业务或费用，还需要根据具体情况进行相应的填制。