在购入机器设备时，其初始价值应该包括以下几个方面：
1. 购买价格：即机器设备的购买成本，包括购买价、运输费、关税等。
2. 安装调试费用：机器设备在安装调试过程中可能需要支付的费用，如安装费、调试费、试车费等。
3. 试运行期间的生产成本：机器设备在试运行期间所产生的生产成本，如电费、水费、人工费等。
4. 其他直接与机器设备相关的费用：如购置保险、专业咨询费用等。

综合以上几个方面的费用，可以确定机器设备的初始价值。在会计实务中，应该将这些费用按照其性质分别计入不同的账户，以便于后续的会计处理和分析。