专项应付款是指企业为了特定的事项而预留的资金，如购置固定资产、支付税费等。如果专项应付款的预留金额超过实际需要，那么剩余部分应该如何处理呢？

根据会计准则的规定，专项应付款剩余部分应当及时清理。具体的处理方法如下：
1. 将剩余部分转移至其他应付款科目，如预收账款、其他应付款等。
2. 如果剩余部分无法转移至其他应付款科目，应当及时予以结转，将其转入当期损益中。具体的操作方法为：在资产负债表中将专项应付款的余额减少，同时在当期损益表中增加相应金额。

需要注意的是，结转专项应付款剩余部分时需要经过企业管理层的决策，并且应当在会计期末完成结转。此外，企业应当保留有关专项应付款的相关文件和凭证，以备查验。