工程类会计中，核算工程成本的方法主要有以下几种：
1. 直接成本法：按照工程实际发生的成本，包括材料、人工、设备使用费用等，直接计入工程成本。
2. 间接成本法：将工程间接费用按照一定的比例或者费率分配到各个工程项目中，计入工程成本。
3. 综合成本法：将直接成本和间接成本合并计算，得出工程的综合成本。
4. 标准成本法：根据预算或者历史数据，制定标准成本，根据实际成本与标准成本的差异进行调整，计入工程成本。

在实际操作中，根据不同的工程类型、规模和复杂程度，可以选择不同的核算方法，以确保工程成本的准确性和可靠性。