房地产开发企业在取得土地使用权后，如果在土地使用权期限内将土地转让或者出售，就需要缴纳土地增值税。缴纳土地增值税的方式如下：
1. 纳税申报：房地产开发企业应当在土地转让或者出售之日起30日内，向税务机关申报土地增值税纳税义务，并提交相关资料。
2. 计算土地增值税：房地产开发企业应当按照国家规定的土地增值税税率和计算方法，计算应纳土地增值税的税额。
3. 缴纳土地增值税：房地产开发企业应当在土地转让或者出售之日起30日内，将应纳土地增值税的税款缴纳至税务机关指定的银行账户。
4. 领取税务机关出具的税务证明：房地产开发企业应当向税务机关申请领取税务证明，以证明已经缴纳了土地增值税。

需要注意的是，房地产开发企业缴纳土地增值税的时限是非常重要的，如果未能按时缴纳，将会被处以罚款等行政处罚。因此，企业应当严格按照规定的时间和程序缴纳土地增值税。