公司购车分期付款的会计分录如下：

借：固定资产（车辆）账户，金额为车辆购买价款的总额

贷：银行账户，金额为首付款的金额

贷：应付账款（分期付款），金额为剩余尚未支付的车辆购买价款的总额

注：在分期付款的情况下，应付账款（分期付款）账户应该按照每期分期付款的金额进行分录。每期付款时，借：应付账款（分期付款）账户，贷：银行账户，金额为当期分期付款的金额。