年终奖个人所得税计算器在计算中需要注意以下几个问题：
1. 确认税前工资总额：在计算年终奖个人所得税前，要先确认税前工资总额，包括基本工资、津贴、奖金、加班费等。
2. 确认税前奖金总额：年终奖个人所得税计算器需要确认税前奖金总额，一般情况下，年终奖的税前金额是税前工资总额的一定比例，如1个月或2个月的工资。
3. 确认适用税率：根据个人所得税法规定，年终奖的个人所得税税率是按照累计收入计算的，因此需要确认本年度累计收入的情况，确定适用税率。
4. 确认起征点：个人所得税起征点是指个人所得税法规定的免征额度，需要确认起征点的金额。
5. 确认减免项目：在计算个人所得税时，需要确认是否有适用的减免项目，如子女教育、住房贷款等。
6. 确认应纳税额：根据以上信息，使用年终奖个人所得税计算器计算出应纳税额，并进行申报缴纳。

总之，在使用年终奖个人所得税计算器时，需要注意确认税前工资总额、税前奖金总额、适用税率、起征点、减免项目等信息，以确保计算结果准确无误。