工程结算是指企业在执行工程项目过程中，按照合同约定或者协议规定，对工程项目进行结算的过程。对于工程结算的会计科目核算方法，一般有以下几种：
1. 按照工程项目的阶段性结算，将工程项目的收入、成本、费用等科目分别核算到不同的阶段中。
2. 按照工程项目的性质和类型，将工程项目的收入、成本、费用等科目分别核算到不同的工程项目中。
3. 按照工程项目的执行方式，将工程项目的收入、成本、费用等科目分别核算到不同的执行方式中，例如自主设计施工、承包施工、代理施工等。
4. 按照工程项目的结算方式，将工程项目的收入、成本、费用等科目分别核算到不同的结算方式中，例如总价合同、分部分项合同、成本加酬金合同等。

需要注意的是，在进行工程结算的过程中，还需要考虑到税收、财务费用等因素，以及合同约定的其他条款，对于这些因素的影响也需要进行相应的会计科目核算。