如果公司已经发出了商品，但是尚未确认收入，那么应该按照以下步骤进行记账：
1. 记录销售收入：在应收账款科目中借记销售收入，同时在销售收入科目中贷记相同金额的销售收入。
2. 记录存货成本：在存货成本科目中借记相应的存货成本，同时在库存商品科目中贷记相同金额的存货成本。
3. 记录销售成本：在销售成本科目中借记相应的销售成本，同时在存货成本科目中贷记相同金额的销售成本。
4. 记录应收账款：在应收账款科目中借记相应的应收账款，同时在销售收入科目中贷记相同金额的应收账款。

需要注意的是，以上记账方法适用于采用销售收入确认制度的企业。如果采用完工百分比法或安装工程法等其他收入确认制度，记账方法可能会有所不同。