“阿米巴”在日文中的意思是“变形虫”。这种变形虫是一种单细胞动物，具有细胞分裂繁殖、适应环境灵活易变等特性。阿米巴模式是由管理会计中的一种责任中心概念SBU（战略业务单元）延伸而来。
阿米巴模式的做法是将整个公司分割成许多个被称为“阿米巴”的小型组织，每个小型组织都作为一个独立的利润中心，按照一个小企业、小商店的方式进行独立经营。每个阿米巴都是一个独立的利润中心，集生产、会计、经营于一体，就像一个中小企业那样活动，所有经营上的事情都有他们自行运作。
通过阿米巴经营模式，管理者追求的是三个目标：第一个是确立与市场挂钩的部门核算制度；第二个是培养具有经营者意识的人才；第三个是实现全体员工共同参与经营。
阿米巴经营模式的基础是分权、分责、分利的组织结构，通过划小核算单元，建立透明的阿米巴核算制度，通过公平公开的核算进行绩效考核；阿米巴运营模式的另一个重要状态是将每个阿米巴视为一个独立的市场主体，通过市场内部交易实现组织市场化，培养自主经营能力，随时观察经营单元的盈亏状态。通过内部交易，使企业内部上下道工序之间以价格为纽带，以服务和资源为商品，进行模拟市场交易。
两个阿米巴之间进行交易就像两个小企业之间在市场上的经营和交易一样，上一个阿米巴生产的东西卖给下一个阿米巴，通过内部交易进行独立核算。因为双方之间互有供给需求，大家都需要对自己的利润负责，一层一层传下去，市场压力就传到了企业内部。
阿米巴经营模式在京瓷和KDDI取得了巨大成功，很多企业纷纷效仿，但阿米巴经营不是人们所称道的万能“经营诀窍”，每个企业都有各自的特点。
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