一般情况下，农合支付的款项通常需要经过医疗保险中心进行结算后再转给医院。 农合（新型农村合作医疗）通常有特定的报销流程和结算机制。患者在医院就医结算时，先按规定比例由个人支付一部分费用，农合应承担的部分由医院先行垫付。之后，医院需要将相关结算数据和资料上报给医疗保险中心，医疗保险中心会进行审核、结算，然后将农合应支付给医院的款项转给医院。 而对于个人账户支付的部分，这部分钱在结算时就直接进入医院账户了。