根据您提供的情况，乙方已经与第三方签订了采购设备协议，并已经支付了设备款项，且第三方已经开具了发票。现在甲方要求乙方开具设备发票，但设备仍然在乙方手中并归乙方使用。 在这种情况下，除了开具销售发票来转移设备的所有权外，还可以考虑以下几种方法： 1.签署设备租赁协议：乙方可以与甲方签署设备租赁协议，将设备出租给甲方使用。这样，乙方仍然保留设备的所有权，但甲方将获得设备的使用权。在租赁期间，乙方可以向甲方收取租金，并在租赁期满后收回设备。 2.签署资产转让协议：乙方可以通过与甲方签署资产转让协议，将设备的所有权转让给甲方。这样，甲方将获得设备的所有权，并承担与设备相关的责任和义务。在资产转让协议中，可以约定设备的价格、交付方式、所有权转移时间等事项。 3.委托代理采购：如果甲方希望获得设备的所有权，但又不想直接与第三方签订采购协议和支付款项，可以考虑委托乙方作为代理进行采购。甲方可以与乙方签署代理采购协议，并支付乙方代理费用。乙方可以代表甲方与第三方签订采购协议，并代为支付设备款项。这样，甲方可以获得设备的所有权，并由乙方承担与设备相关的责任和义务。