总局公告2017年40号，（二）企业取得研发过程中形成的下脚料、残次品、中间试制品等特殊收入，在计算确认收入当年的加计扣除研发费用时，应从已归集研发费用中扣减该特殊收入，不足扣减的，加计扣除研发费用按零计算。 问题：1，“从已归集研发费用中扣减该特殊收入”，这里的被减数“已归集研发费用”，是指计算加计扣除费用的“基数”，还是指“计算确认后”的加计扣除费用？ 2.这里的意思只是说，如果有下脚料等特殊收入，计算加计扣除的基数要扣减，实质上就是不让产生特殊收入对应的材料“加计扣除”，但是“据实扣除”还是可以的，是吗？ 3.请举例子说明这个规定。