是的，电子专用发票可以抵扣税款。电子专用发票是指中华人民共和国国家税务总局发布的电子技术标准下的一种发票，它的数据格式符合专用发票的国家标准。电子专用发票可以被密码保护，并且可以验证真伪，可以用于税务登记和填报，也可以用于税收减免、增值税进项税额抵扣申报等用途。 拓展知识：电子专用发票必须经过认可机构的认证，拥有正确的税号、发票代码、发票号码、开票日期、校验码等信息，才可以抵扣税款。此外，企业应及时将电子专票信息上传至税务机关，以便税务机关进行发票验真与税收征管工作。