当企业由小规模纳税人变成一般纳税人时，发票开具标准也要发生变化，企业不能直接把一般纳税人发票开具抵扣。就您公司这样的情况，因为对方已经开具13%的专票，所以即便您公司后期变成一般纳税人，也不能把13%的专票抵扣，应该把以前发放的13%的专票转换成一般纳税人发票，完成相应的重新开具程序后，即可抵扣。 举个例子来说，如果您的公司是一家制造企业，其他公司为您采购产品，对方开具的是13%的专票，您的公司后期变成一般纳税人，只能把13%的专票转换成一般纳税人发票。