是的，在开票时，付款单位跟开票单位可以不一样。按照《中华人民共和国税收征收管理法》规定，企业向收取款项的单位开具增值税发票的，应当开具收款单位按实际付款人指定的银行账户名称，方可被税务机关作为付款凭证，进而能够享受正常税收减免政策。 拓展资料： 《中华人民共和国税收征收管理法》（2018年版）是中华人民共和国最高立法机关，中华人民共和国全国人民代表大会常务委员会于2018年10月31日通过，实施日为2019年1月1日，发布于2019年1月1日，主要规定了货物及劳务税收征管、财产税收征管等。