是的，个体户雇员可以直接进入自然人电子税务局代扣代缴界面，给员工申报个税。但是要使用此功能，个体户需要先到税局开通代扣代缴个税功能，确认款项付款人身份信息、扣款账户和个税申报等，同时将确认信息上传到税务机关服务系统。然后进入税务局网站，在个体户代扣代缴个税申报办理服务中，进行申报确认提交即可。为了保障安全，个体户需要单独登录税务局网站，同时需要申报的款项必须在税局指定的账号上进行缴纳。 另外，个体户可以通过社会保险个体申报系统，完成对企业个体工商户的财务申报、代扣代缴、单位缴费等操作，降低企业财务管理成本。