您好，根据《中华人民共和国税收征收管理法》相关规定，跨区工程小规模纳税人去税务代开3%专票，不能直接交的税算预交增值税。因为小规模纳税人免征增值税，只有当发生实际税务征税的情况时，小规模纳税人才需要缴纳增值税，所以跨区工程小规模纳税人去税务代开3%专票，不能直接交的税算预交增值税。 而且，小规模纳税人按照规定应按月填制增值税纳税申报表，并于税务机关规定的期限内进行纳税申报，一旦发生实际应纳税，即需按规定计算依法纳税。 此外，小规模纳税人在特定情况下，还可以申请实施所得税减免等优惠政策，而非小规模纳税人则无法享受此类政策。因此，跨区工程小规模纳税人在纳税申报、享受优惠等方面有着较大的优势。