小规模免税经营部开发票购买的白芸豆应该按照国家税法规定的税率征收增值税。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第四十九条的规定，白芸豆属于增值税一般纳税人按照6%的税率办理纳税手续。但是小规模纳税人可以按照简易计税或税率适用于小规模纳税人按增值税3%的税率征税。 另外，根据国家新出台的《中华人民共和国增值税条例》第十一条规定，发票上开具税率也应当体现出折扣等减免税情况，以便使开票主体向发票收票方提供减免税情况的证明。 此外，白芸豆作为食品的销售，还可以根据国家有关规定，减按照一定比例征收增值税，以减轻企业的税负。自2019年5月1日起，国家减按范围内生鲜乳制品等九类食品，即由正常税率6%减按为零税率。因此，购买白芸豆的税率也会有所减免，从而降低购买白芸豆的税负。