你好，在投标时按9%的税金投标中标，结算时也是按9%的税率结算付款的情况下，施工单位开的发票税率不能低于投标时所报的税率，也就是说施工单位开的发票税率只能为9%，不能按3%开票。具体原因是，企业在缴纳税款时，按照发票上的税率缴纳，如果发票上的税率低于应缴的税率，企业就会被责令补缴税款。 拓展知识：发票作为确认企业及其客户经济活动的重要凭证，发票的开具、使用、收回等全部程序中都要遵守税收法律规定，以防止发生税收偷税漏税的状况。