一般来说，跨期未交款的印花税是可以作废的。您所做的操作应当不会有影响，因为您所作废的印花税已经被系统标记为“作废”，其后的税务审核程序将不会考虑到这条印花税。不过为了保证最终的审核结果准确无误，建议您把两条印花税的申报细节都列出来，比如申报的类型、申报的日期、应缴款项等，并请税务机关审核。 另外，申报印花税还需要注意其他几个方面：首先，要检查是否有任何免税或减税政策；其次，印花税申报日期要准确，不要迟于法定实施日期；最后，申报印花税时，要仔细审核和核对质证书，确保税务审核时不会出现瑕疵。