专业分包单位和总承包施工单位在工程项目核算中有可观的不同。专业分包单位是指工程项目核算中的分支机构，以及派遣的专业分包人员，他们的职责是承担工程项目中某专业的所有任务，直接参与工程项目的项目建设，并负责某一阶段或者某个专业的工作，例如：建筑、给排水、电气安装、智能化系统等等。而总承包施工单位，则是指在整个工程项目核算中负责统筹，协调、指导、监督等项目建设管理工作，他们负责统筹建设工程，策划组织配置项目施工，同时负责指导各个专业分包单位完成其承担的工作，并最终完成项目的建设任务。 从项目管理的角度来看，总承包施工单位主要负责工程项目的总体组织和管理，而专业分包单位则负责具体某个专业的工作，两者有其各自的职能，因此在核算上应分开计算。另外，核算时，专业分包单位的费用应只包括专业分包的费用，而不包括总承包施工单位的费用，原因是总承包施工单位的费用不在分包范围之内，所以不应该是分包单位支付的。