在小规模公司发票开了，款没进账的情况下，是否应该继续做零申报，这需要根据具体情况来判断。如果发票上的货物服务的收入并未实际入账，则可以按照税收筹划计划，继续进行零申报，以便获得应税收入所得减除。如果款项已进入小规模公司账户，则此款项需要特别注意，避免发票开出但款项未进账，因此在此情况下不应按零申报。 此外，小规模企业要注意不同业务收入记账和发票开具时间上的差异。一般而言，业务收入在本月发生或收款，发票开具时间在后一月初，如果时间差距较大，小规模企业要根据实际情况，妥善处理发票开具和记账等工作，以保证纳税义务的满足。