物流公司可以按照3%的简易计税，具体来说，就是税务机关会根据物流公司的总收入，选择最低比例计税，也就是3%。通常来说，这种计税方式对企业来说比较利，可以有效减少企业的税负。但是也有一定的弊端，首先，物流公司必须明确自己的收入，并且不能有违规行为，否则会被税务机关给处以惩戒性税收。此外，税收计算也需要物流公司高度重视，拿准位置，不然容易计算失误，影响收入。拓展知识：另外，税务机关也会提供电子发票和网上报税等自助服务，物流公司可以根据实际情况，合理选择最佳税收优化方式。