应该使用“货物未达”账户，具体分录如下： 银行账户：借：xxx；贷：货物未达 货物未达账户：借：xxx；贷：原材料 原材料账户：借：xxx；贷：库存现金 库存现金账户：借：货物未达；贷：xxx 上述分录中xxx表示货物短缺的金额，可通过计算得出。 以上就是关于原材料入库时发现短缺为运输途中合理损耗，已退回余款的分录写法。其实，在分录时，应根据公司实际情况，将短缺的金额归入合适的账户，以避免影响公司资金报表的准确性。