这样做并不合法。根据税收管理法规，税务机关将从纳税人收获的税款，并将税款凭证有效地履行并记录后，需要对收入的明细进行登记、审核及差错处理。因此，劳务公司给甲方开发票，收取款项，同时将收取的税款交给农民工专用账户的行为，不仅不符合税收管理的规定，而且会影响税务管理的公平性。 劳务费发放明细和发票是两个不同的内容，发放明细是按照发放结构和额度分开登记，而发票是对发放明细中收入的验证，作为发放结构的一个重要部分，它为发放服务提供证据。发票必须与发放明细相结合，劳务公司必须根据劳务费发放明细报送税收，否则将影响税务局的税收管理。 拓展知识：劳务费发放的税务备案是指将劳务支付明细和发票备案税务机关，以资证明税务事务的备案程序。备案的内容包括劳务发放明细、发票所示发放金额、发放日期、受益人等信息，以及劳务发放者、受发放者等信息，作为税务机关审验和处理发放税收的重要依据。